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Séquence du génome complet d’un troisième baculovirus isolé de la légionnaire uniponctuée, Mythimna unipuncta, contenant deux copies du gène lef-7

Harrison, R.L., Mowery, J.D., Rowley, D.L., Bauchan, G.R., Theilmann, D.A., Rohrmann, G.F., Erlandson, M.A. (2018). The complete genome sequence of a third distinct baculovirus isolated from the true armyworm, Mythimna unipuncta, contains two copies of the lef-7 gene, 54(2), 297-310. http://dx.doi.org/10.1007/s11262-017-1525-0

Résumé

© 2017. Ce document du gouvernement des États-Unis n’est pas protégé par le droit d’auteur aux États-Unis; des droits d’auteur d’autres pays peuvent s’appliquer. Un isolat de baculovirus provenant d'une collection de l'USDA Forest Service a été caractérisé par microscopie électronique et par l’analyse de la séquence de son génome. La PCR de codes-barres a permis de déterminer que l'isolat, anciennement appelé Nucleopolyhedrovirus no 7 de Pseudoletia (Mythimna) sp. (MyspNPV#7), provenait de l'espèce hôte Mythimna unipuncta (légionnaire uniponctuée) et il a été renommé Nucleopolyhedrovirus no 7 de Mythimna unipuncta (MyunNPV#7). Les corps d'occlusion (OB, pour occlusion bodies) et les virions avaient une taille et une morphologie typiques des OB produits par les espèces du genre Alphabaculovirus, les virions dérivés des OB étant constitués de 2 à 5 nucléocapsides dans une même enveloppe. Le génome de MyunNPV#7 comportait 148 482 pb avec une distribution nucléotidique G+C de 48,58 %. Au total, 159 ORF de 150 pb ou plus ont été annotés dans la séquence du génome, dont les 38 gènes de base de la famille des Baculoviridae. Le génome contenait six séquences homologues répétitives constituées de multiples copies d'un palindrome imparfait de 34 pb. L'inférence phylogénétique à partir des alignements de séquences d'acides aminés des gènes de base concaténés du baculovirus a placé MyunNPV#7 avec les Alphabaculovirus du groupe II isolés d'autres espèces hôtes de légionnaire uniponctuée et de vers gris de la famille des Noctuidae. MyunNPV#7 se distingue des autres virus du groupe par des différences dans le contenu génique et l'ordre des gènes. Les distances de nucléotides appariés suggèrent que MyunNPV#7 représente une espèce distincte chez les Alphabaculovirus. Le génome de MyunNPV#7 contient deux copies du gène lef-7 (facteur d'expression tardive-7), une caractéristique qui n'a été signalée pour aucun autre génome de baculovirus à ce jour. Les deux copies du gène lef-7 codent un domaine F-box, qui est nécessaire pour la fonction de la protéine LEF-7 dans la réplication de l'ADN des baculovirus.

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