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Tagging and mapping candidate loci for vernalization and flower initiation in hexaploid oat

Nava, I.C., Wight, C.P., Pacheco, M.T., Federizzi, L.C., et Tinker, N.A. (2012). « Tagging and mapping candidate loci for vernalization and flower initiation in hexaploid oat. », Molecular Breeding, 30(3), p. 1295-1312. doi : 10.1007/s11032-012-9715-x  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

La date de floraison est un facteur déterminant du degré d’adaptation de l’avoine. Certaines variétés de cette céréale exigent une basse température pour le déclenchement de la floraison, processus appelé « vernalisation ». La présente étude visait à cloner, caractériser et cartographier les gènes de l’avoine associés à la vernalisation et à trouver des marqueurs liés aux locus quantitatifs (QTL) intervenant dans la réaction de la plante à la vernalisation. En nous fondant sur les marqueurs DArT (Diversity Arrays Technology) de lignées pures recombinantes, nous avons établi la carte de liaisons génétiques de deux populations d’avoine, UFRGS 8 9 UFRGS 930605 et UFRGS 881971 9 Pc68/5*Starter. Nous avons caractérisé la date de floraison et la réaction à la vernalisation au moyen d’essais au champ et d’expériences en serre en conditions contrôlées, et nous avons repéré des QTL dans deux régions génétiques de chacune des deux cartes. Nous avons ensuite employé des paires d’amorces PCR ancrées sur les régions codantes conservées des gènes Vrn1, Vrn2 et Vrn3 du blé, de l’orge et du genre Lolium pour amplifier et cloner les séquences correspondantes de l’avoine. Nous avons ainsi repéré des séquences correspondant aux gènes ciblés Vrn1 et Vrn3. Nous avons établi la position d’une copie du gène Vrn3, au moyen d’un amplicon PCR, ainsi que d’un fragment Vrn1 de l’avoine, par analyse RFLP. La position de ce locus Vrn1 était homologue aux principaux QTL influant sur la date de floraison selon d’autres travaux et homéologue aux principaux QTL influant sur la réaction à la vernalisation selon la présente étude.

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