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Molecular identification of rumen methanogens: Technologies, advances and prospects

Zhou, M., McAllister, T.A., et Guan, L.L. (2011). « Molecular identification of rumen methanogens: Technologies, advances and prospects. », Animal Feed Science and Technology, 166-167, p. 76-86. doi : 10.1016/j.anifeedsci.2011.04.005  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

La méthanogenèse est un moyen d’éliminer le H2 et de maintenir une faible pression partielle de H2 dans le rumen, condition essentielle d’une fermentation ruminale efficiente. Comme les organismes méthanogènes ont d’importantes exigences culturales, seules quelques espèces ont pu être isolées du rumen et mises en culture. Les approches faisant intervenir des méthodes moléculaires sans culture ont permis de jeter un nouvel éclairage sur la diversité, l’abondance et le rôle des organismes méthanogènes dans la flore microbienne ruminale. En outre, avec les récents progrès de la technologie de séquençage de nouvelle génération, la flore microbienne ruminale a pu être étudiée à l’échelle métagénomique, ce qui a apporté de l’information pour explorer la structure, la fonction et la diversité métabolique des communités microbiennes. Dans cette revue documentaire, nous faisons le tour des technologies moléculaires utilisées dans les travaux sur les organismes méthanogènes ruminaux en signalant leurs avantages et leurs limites, et nous présentons les applications des approches de séquençage de nouvelle génération pour l’étude de l’écologie des organismes méthanogènes ruminaux. Ces approches pourraient permettre de voir sous un autre angle les mécanismes de la méthanogenèse ainsi que les interactions des organismes méthanogènes avec les autres microbes de la flore ruminale. Comprendre le rôle fondamental des organismes méthanogènes dans la production du CH4 ruminal serait utile pour trouver des moyens de réduire les émissions de ce gaz à effet de serre chez les ruminants.

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