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Comparative analysis of gene expression profiles in ruminal tissue from Holstein dairy cows fed high or low concentrate diets

Taniguchi, M., Penner, G.A., Beauchemin, K.A., Oba, M., et Guan, L.L. (2010). « Comparative analysis of gene expression profiles in ruminal tissue from Holstein dairy cows fed high or low concentrate diets. », Comparative Biochemistry and Physiology - Part D: Genomics and Proteomics, 5(4), p. 274-279. doi : 10.1016/j.cbd.2010.07.004  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

Souvent, on donne aux bovins une ration riche en concentré (RC) afin d’accroître leur productivité malgré le fait que ce genre de ration provoque des modifications dans le milieu ruminal, comme une réduction du pH. Or, en dépit du fait que ces modifications aient été abondamment étudiées, il n’y a en ce moment que très peu de données concernant les phénomènes moléculaires régulant l’environnement ruminal. Notre objectif était de caractériser, à l’aide d’une biopuce 24 k pour bovins, l’expression différentielle des gènes des tissus du rumen de vaches Holstein nourries avec une ration RC ou avec une ration pauvre en concentré (PC). Nous avons détecté en tout 5 200 gènes exprimés différentiellement (GED) chez les vaches recevant une ration RC et chez celles recevant une ration PC. Nous avons commencé l’annotation des GED à l’aide des bases de données Gene Ontology (GO) et Kyoto encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG), ce qui a révélé qu’ils étaient liés à une activité catalytique et à la voie MAPK, respectivement. Nous avons poussé la caractérisation pour éclaircir les relations entre les groupes d’annotations des GED au moyen du répertoire de schémas d’interrelations entre annotations de la base GeneCodis, ce qui a révélé qu’une sous-unité catalytique bêta de la protéine kinase A (AMPc-dépendante) [PRKACB] était possiblement associée à l’entretien des tissus du rumen. Nos résultats nous ont permis de mieux comprendre les mécanismes de régulation reliés à l’ARNm chez les vaches Holstein consommant des rations à différentes teneurs en concentré.

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