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Isolation and characterization of the rye Waxy gene

Xu, J.H., Frick, M., Laroche, A., Ni, Z.-F., Li, B.Y., et Lu, Z.-X. (2009). « Isolation and characterization of the rye Waxy gene. », Genome, 52(7), p. 658-664. doi : 10.1139/G09-036  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

Des séquences génomiques et ADNc complètes du gène Waxy, lequel code pour l’amidon synthétase liée au grain I (GBSSI), ont été clonées et caractérisées chez le seigle. Les clones génomiques et ADNc du gène Waxy mesurent respectivement 2767 pb et 1815 pb. La séquence génomique compte 11 exons interrompus par 10 introns. Le gène Waxy du seigle est riche en GC et affiche une fréquence plus élevée en GC dans la région codante, particulièrement à l’endroit de la troisième position des codons. Les exons du gène Waxy du seigle sont plus conservés que les introns lorsque ces séquences sont comparées à leurs homologues chez d’autres céréales. Les protéines GBSSI matures présentent plus de 95 % d’identité avec leurs homologues chez le blé et l’orge. Un arbre phylogénétique comprenant les séquences de toutes les protéines GBSSI connues chez les plantes montre les relations évolutives entre les gènes Waxy du seigle et des autres plantes. L’identification du gène Waxy chez le seigle rendra possible la manipulation du métabolisme de l’amidon chez le seigle et le triticale.

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