Sélection de la langue

Recherche

An Algorithm to Sort Complex Pedigree Chronologically without Birthdates.

Zhang, Z., Li, C., Todhunter, R.J., Lust, G., Goonewardene, L., et Wang, Z. (2009). « An Algorithm to Sort Complex Pedigree Chronologically without Birthdates. », Journal of Animal and Veterinary Advances, 8(1), p. 177-182.

Résumé

La relation génétique additive entre les individus ayant des liens généalogiques est un paramètre qu’il est essentiel de connaître dans les analyses génétiques pour estimer les composantes de variance, prédire les valeurs d’élevage et établir la cartographie d’association des locus quantitatifs (QTL) de manière à ce que les effets polygéniques généraux puissent être déterminés. Pour calculer la relation génétique additive à l’aide des données généalogiques, il faut classer les individus par ordre chronologique de telle sorte que les parents précèdent leurs descendants. Ce classement est possible au moyen des dates de naissance. En pratique cependant, la date de naissance n’est pas toujours connue pour tous les individus, soit parce que l’information n’a pas été conservée ou parce qu’elle comporte des erreurs ou des inexactitudes. Dans la présente étude, nous avons élaboré un algorithme pyramidal fondé sur les données parentales de la généalogie afin d’obtenir des données classées par ordre chronologique où les parents précèdent leurs descendants et nous avons créé un logiciel (SeqPed) reposant sur cet algorithme. L’ordre chronologique des individus et la matrice des relations génétiques additives déterminés au moyen de la généalogie d’un chien comprenant toutes les dates de naissance correspondaient à ce que nous avons déterminé d’après la généalogie et l’ordre chronologique établi au moyen du logiciel sans les dates de naissance.

Signaler un problème sur cette page
Veuillez cocher toutes les réponses pertinentes :
Date de modification :