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Nguyen, Hai, Ph. D.

Chercheur scientifique

Coordonnées :

960 Avenue Carling
Ottawa, Ontario K1A 0C6
Téléphone : 613-759-1579
Courriel : Hai.Nguyen@agr.gc.ca

Domaines d'expertise :

  • Biosystématique
  • Génomique comparative
  • Bioinformatique
  • Synchytrium
  • Pythium

Projets en cours :

  • Recherche taxonomique, phylogénétique et phylogénomique sur les champignons chytrides et les oomycètes.
  • Génomique comparative des agents pathogènes fongiques et en particulier de l’agent responsable de la galle verruqueuse (Synchytrium endobioticum).
  • Élaboration, tenue à jour et caractérisation à l’échelle de l’ADN des collections de référence de champignons, à savoir la Collection de cultures fongiques canadiennes (CCFC) et de l’Herbier national de mycologie (DAOM) d’AAC.
  • Élaboration de pipelines bio-informatiques et d’outils permettant la détection/l’identification rapide.

Affiliations :

  • Membre de la Mycological Society of America
  • Membre de l’American Phytopathological Society
  • Membre de l’International Commission on the Taxonomy of Fungi
  • Membre de l’Association internationale de mycologie

Publications de recherche

2019

  • Bromfield, E.S.P., Cloutier, S., Nguyen, H.D.T. (2019). Description and complete genome sequence of bradyrhizobium amphicarpaeae sp. Nov., harbouring photosystem and nitrogenfixation genes, 69(9), 2841-2848. http://dx.doi.org/10.1099/ijsem.0.003569

2016

  • Hirooka, Y., Tanney, J.B., Nguyen, H.D.T., Seifert, K.A. (2016). Xerotolerant fungi in house dust: Taxonomy of Spiromastix, Pseudospiromastix and Sigleria gen. nov. in Spiromastigaceae (Onygenales, Eurotiomycetes), 108(1), 135-156. http://dx.doi.org/10.3852/15-065
  • Wingfield, B.D., Ambler, J.M., Coetzee, M.P.A., De Beer, Z.W., Duong, T.A., Joubert, F., Hammerbacher, A., McTaggart, A.R., Naidoo, K., Nguyen, H.D.T., Ponomareva, E., Santana, Q.S., Seifert, K.A., Steenkamp, E.T., Trollip, C., van der Nest, M.A., Visagie, C.M., Wilken, P.M., Wingfield, M.J., et Yilmaz, N. (2016). « Draft genome sequences of Armillaria fuscipes, Ceratocystiopsis minuta, Ceratocystis adiposa, Endoconidiophora laricicola, E. polonica and Penicillium freii DAOMC 242723. », IMA Fungus, 7(1), p. 217-227. doi : 10.5598/imafungus.2016.07.01.11

2015

  • Jančič, S., Nguyen, H.D.T., Frisvad, J.C., Zalar, P., Schroers, H.-J., Seifert, K.A., et Gunde-Cimerman, N. (2015). « A Taxonomic Revision of the Wallemia sebi Species Complex. », PLoS ONE, p. 1-25. doi : 10.1371/journal.pone.0125933
  • Nguyen, H.D.T., Chabot, D., Hirooka, Y., Roberson, R.W., et Seifert, K.A. (2015). « Basidioascus undulatus: Genome, origins, and sexuality. », IMA Fungus, 6(1), p. 215-231. doi : 10.5598/imafungus.2015.06.01.14
  • Nguyen, H.D.T., Jančič, S., Meijer, M., Tanney, J.B., Zalar, P., Gunde-Cimerman, N., et Seifert, K.A. (2015). « Application of the phylogenetic species concept to wallemia sebi from house dust and indoor air revealed by multi-locus genealogical concordance. », PLoS ONE, 10(3: Article number e0120894). doi : 10.1371/journal.pone.0120894
  • Pratibha, J., Nguyen, H.D.T., Mel'nik, V.A., Bhat, D.J., White, G.P., et Seifert, K.A. (2014). « Lectotypification, epitypification, and molecular phylogeny of the synnematous hyphomycete Pseudogliophragma indicum, the second genus in the Wiesneriomycetaceae. », Mycoscience, 56(4), p. 387–395. doi : 10.1016/j.myc.2014.12.002
  • Tanney, J.B., Nguyen, H.D.T., Pinzari, F., et Seifert, K.A. (2015). « A century later: rediscovery, culturing and phylogenetic analysis of Diploöspora rosea, a rare onygenalean hyphomycete. », Antonie Van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology, 108(5), p. 1023-1035. doi : 10.1007/s10482-015-0555-7
  • Wingfield, B.D., Barnes, I., De Beer, Z.W., De Vos, L., Duong, T.A., Kanzi, A.M., Naidoo, K., Nguyen, H.D.T., Santana, Q.C., Sayari, M., Seifert, K.A., Steenkamp, E.T., Trollip, C., van der Merwe, N.A., van der Nest, M.A., Wilken, P.M., et Wingfield, M.J. (2015). « Draft genome sequences of Ceratocystis eucalypticola, Chrysoporthe cubensis, C. deuterocubensis, Davidsoniella virescens, Fusarium temperatum, Graphilbum fragrans, Penicillium nordicum, and Thielaviopsis musarum. », IMA Fungus, 6(2), p. 493-506. doi : 10.5598/imafungus.2015.06.02.13

2014

  • Nguyen, H.D.T., Tanney, J.B., Chabot, D., Nickerson, N.L., et Seifert, K.A. (2014). « Paratritirachium curvibasidium, a new heat-resistant basidiomycete from flare pit soils in Alberta, Canada. », Mycological Progress, 13(3), p. 575-587. doi : 10.1007/s11557-013-0941-3

2013

  • Nguyen, H.D.T., Nickerson, N.L., et Seifert, K.A. (2013). « Basidioascus and Geminibasidium: a new lineage of heat resistant and xerotolerant basidiomycetes », Mycologia, 105(5), p. 1231-1250. doi : 10.3852/12-351

Autres publications relatives à la science

2019

  • M. Liu, W. Findlay, P. Shoukouhi, K. Dadej, H. D. T. Nguyen, J. G. Menzies, K. A. Seifert. 2019. A reminiscence of evolutionary hourglass: The pattern of ergot alkaloid gene divergence in Claviceps purpurea.
  • Nguyen HDT, Grunwald NJ, Abad ZG, Martin FN, Crouch J, Hambleton S, Dettman J, Liu M, Harris LJ, Castlebury L, Salagado-Salazar C, Cowger C, Ellouz O, Mollov D, Fall ML, Ling K, Griffifths J, Mahaffee W, Chen W, Sultata T, Yu Q, Carta LK, Skantar AM, Tambong J, Rogers E, Li S, Dumonceaux TJ, Widmer TL. The 2019 AAFC-USDA meeting on genotyping and monitoring of high-risk plant pathogens.
  • Tremblay, É. D., D. Shearlaw, H. D. T. Nguyen, and S. Hambleton. 2019. Laboratory testing of qPCR assays designed in silico reveal promising results to rapidly identify phytopathogenic Tilletia species. In Plant Canada 2019 meeting. July 7-10 2019, Guelph, Ontario, Canada. (Poster).
  • van de Vossenberg BLTH, van der Lee TAJ, Nguyen HDT. 2019. The 2019 Potato Wart Disease workshop - shared needs and future research directions. Published online: https://english.nvwa.nl/topics/national-plant-protection-organization-nppo/potato-wart-disease-workshop

2018

  • Evaluating gene regions for phylogenetic species delimitation in the P. irregular species complex
  • Rintoul TL, Levesque CA, Nguyen HDT. Systematic analyses of terrestrial obligate Synchytrium species based on molecular characterisation. Poster presented at the 11th International Mycological Congress in Puerto Rico (July 2018).

2016

  • Nguyen HDT, Smith D, Li X, Gagnon M-C., Bilodeau G, van de Vossenberg B, van der Lee TAJ, Joly D, Levesque CA. 2016. Sixteen years of potato wart research collaboration between CFIA and AAFC. Poster presented at the 2016 CFIA Science Cafe in Ottawa.
  • Nguyen HDT, van de Vossenberg B, van der Lee TAJ, Joly D, Smith D, van Gent-Pelzer M, Bonants PJM, Levesque CA. 2016. Genome sequencing of Synchytrium endobioticum offers insight into its carbohydrate degrading enzymes. Poster presented at the 2016 American Phytopathological Society (APS) Annual Meeting in Tampa, Florida.
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