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Yuan, Ze-Chun

Chercheur

Coordonnées :

1391 Sanford St
London, (Ontario) N5V 4T3
Téléphone : 519-953-6641
Télécopieur : 519-457-3997
Courriel : yuanz@agr.gc.ca

Domaines d'expertise :

  • Interactions moléculaires entre plantes et microbes, microbiologie appliquée et environnementale
  • Génétique moléculaire microbienne, régulation des gènes, transduction du signal
  • Maladies de la galle du collet causées par Agrobacterium, facteurs de virulence, pathogenès
  • Phytobactériologie, profilage de transciption, caractérisation d'éliciteurs
  • Pathologie des plantes et biologie molécular des plantes, métabolisme secondaire des plantes
  • Résponses des phytopathogènes à l'environnement et aux signaux de la plante hôte, génétique fonctionelle, voies de signalisation, réseaux génétiques, et biologie des systèmes
  • Biochimie et réponses des plantes aux phytopathogènes, vioes de régulation
  • Criblage de molécules chimiques d'origine microbienne ayant une activité antimicrobienne
  • Stimulation de la croissance des plantes par les microbes, en particulier par les rhizobactéries (PGPR, endophytes, épiphytes, agenets de biocontrôle et biofertilisants)
  • Métagénomique, écologie moléculaire microbienne

Projets en cours :

  • Détermine comment les pathogénes des végétaux reconnaissent et répondent aux signaux environnementaux extracellulaires et aux signaux de la plante hôte : quels sont les gènes impliqués et comment la voie de signalisation est intégrée et orchestrée au niveau des systèmes (facteurs de virulence d'Agrobacterium, pathogénicité, génomique fonctionelle)
  • Étudie de façon systématique les effets des signaux chimiques d'origine végétale et microbienne sur la colonisation d'Agrobacterium, la formation de biofilms, la pathogénicité, la notion d'aptitude adaptive fitness, les communications entre cellules (aussi appelées quorum sensing) et ses associations avec la plate hôte, et explore les mécanismes moléculaires sous-jacents
  • Examine comment a plante hôte reconnaît et répond aux signaux produits par les microorganismes et les microbes (biologie moléculaire des plantes, emphase sur les voies de régulation ou de signalisation des plantes et réponses aux phytopathogènes)
  • Métagénomique : analyse fonctionelle des commuautés microbiennes dans la rhizoshères, dont les endophytes (microbes se développant à l'intérieur de la hôte) et les épiphytes (microbes se développant à la surface des plantes) participant au cycle des éléments nutrifs, à la biorémediation et à la stimulation de la croissance, à la santé, à la productivité des plantes et à leur tolérance aux stress biotiques et abiotiques (biocontrôles, biofertillisants, agents de la rhizosphère stimulation la croissance des plantes), produit des biocarburants cellulosiques ou de nouveaux composés ayant une activité antimicrobienne
  • Criblage de produits naturels d'origine végétale, la population, la diversité et les fonctions (approchemétagénomique) microbiennes (bactéries et champignons) de la rhizosphères
  • Découvre, développe, évalue et utilise des agents microbiens pour le contrôle biologique des pathogènes des plantes, en particulier les maladies des plantes transmises par le sol en agriculture et en horticulture
  • Détermine comment les agents de biocontrôle microbien survivent et font compétition aux microbes d'origine dans la rhizosphères
  • Développe de nouveaux protocoles ou de nouvelles solutions qui stimulent la croissance des microbes bénéfiques dans la rhizosphères

Publications de recherche

2017

  • Aung B, Gao R, Gruber MY, Yuan Z-C, Sumarah M, Hannoufa A.* (2017). MsmiR156 affects global gene expression and promotes root regenerative capacity and nitrogen fixation activity in alfalfa. Transgenic Res. 26: 541-557
  • Chen C, Li C, Wang Y, Renaud J, Tian G, Kambhampati S, Saatian B, Nguyen V, Hannoufa A, Marsolais F, Yuan ZC, Yu K, Austin RS, Liu J, Kohalmi SE, Wu K6, Huang S, Cui Y (2017). "Cytosolic acetyl-CoA promotes histone acetylation predominantly at H3K27 in Arabidopsis". Nature Plants. 3(10):814-824. doi: 10.1038/s41477-017-0023-7. Epub 2017 Sep 25.
  • Hassan, I., Mohamedelhassan, E., Yanful, E.K., Yuan, Z.C. (2017). Solar power enhancement of electrokinetic bioremediation of phenanthrene by Mycobacterium pallens, 21(2), 53-70. http://dx.doi.org/10.1080/10889868.2017.1312264
  • Ho, M.T., Weselowski, B., Yuan, Z.C. (2017). Complete genome sequence of Acinetobacter calcoaceticus CA16, a bacterium capable of degrading diesel and lignin, 5(24), http://dx.doi.org/10.1128/genomeA.00494-17
  • Nathoo, N., Bernards, M.A., MacDonald, J., Yuan, Z.C. (2017). A hydroponic Co-cultivation system for simultaneous and systematic analysis of plant/microbe molecular interactions and signaling, 2017(125), http://dx.doi.org/10.3791/55955
  • Zekic, F., Weselowski, B., Yuan, Z.C. (2017). Complete genome sequence of Burkholderia cenocepacia CR318, a phosphate-solubilizing bacterium isolated from corn root, 5(23), http://dx.doi.org/10.1128/genomeA.00490-17

2016

  • Grady EN, MacDonald J, Liu L, Richman A, Yuan ZC. Current knowledge and perspectives of Paenibacillus: a review. Microb Cell Fact. 2016 Dec 1;15(1):203. Review. PMID: 27905924 PMCID: PMC5134293 DOI: 10.1186/s12934-016-0603-7
  • Hassan, I., Eastman, A.W., Weselowski, B., Mohamedelhassan, E., Yanful, E.K., et Yuan, Z.-C. (2016). « Complete Genome Sequence of Arthrobacter sp. Strain LS16, Isolated from Agricultural Soils with Potential for Applications in Bioremediation and Bioproducts. », Genome Announcements, 4(1: e01586), p. 15. doi : 10.1128/genomeA.01586-15
  • Hassan, I., Mohamedelhassan, E., Yanful, E.K., et Yuan, Z.-C. (2016). « A Review Article: Electrokinetic Bioremediation Current Knowledge and New Prospects. », Advances in Microbiology, 6(1), p. 57-72. doi : 10.4236/aim.2016.61006
  • Weselowski, B., Nathoo, N., Eastman, A.W., MacDonald, J., Yuan, Z.C. (2016). Isolation, identification and characterization of Paenibacillus polymyxa CR1 with potentials for biopesticide, biofertilization, biomass degradation and biofuel production, 16(1), http://dx.doi.org/10.1186/s12866-016-0860-y

2015

2014

2012

  • Yuan, Z.-C. et Williams, M. (2012). « A Really Useful Pathogen, Agrobacterium tumefaciens. », Plant Cell, 24(11, Article No. 10 tpc.112.tt1012). doi : 10.1105/tpc.112.tt1012

Autres publications relatives à la science

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