Cloutier, Sylvie, Ph.D.

Généticienne moléculaire


Coordonnées :

960, av. Carling
Ottawa, (Ontario) K1A 0C6
Téléphone : 613-759-1744
Télécopieur : 613-759-1937
Courriel : sylvie.j.cloutier@agr.gc.ca

Domaines d'expertise :

  • banque d'ADN complémentaire
  • génomique
  • banque de chromosomes bactériens artificiels
  • séquençage
  • clonage

Projets en cours :

  • Construction de cartes physiques de traits importants liés à la qualité des semences
  • Identification des gènes de résistance à la maladie du blé par l'utilisation de biopuces dans un jeu ordonné de microéchantillons
  • Clonage et séquençage fondés sur la cartographie du gène de la résistance à la rouille brune Lr1
  • Génétique moléculaire du système pathogène de la rouille brune : établissement de profils de l'expression des gènes utilisant un jeu ordonné de microéchantillons

Publications de recherche :

Les liens ci-dessous mènent aux résumés avec accès au texte intégral.

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

Autres publications relatives à la science :

2016

  • Cloutier, S., Deyholos, M.K., Ragupathy, R., Zhu, T., Li, P., Luo, M.-C., et You, F.M. (2016). « BioNano optical map improves the flax reference genome. », XXIV Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, January 9-13, 2016.
  • Fofana, B., Ghose, K., McCallum, J.L., Somalraju, A., Cloutier, S., Deyholos, M.K., et Rowland, G.G. (2016). « Developing EMS flax mutant lines with altered SDG lignan glucosides. », PAGXXIV 2016, San Diego, USA, January 9-13, 2016.
  • Fofana, B., Ghose, K., McCallum, J.L., Somalraju, A., Cloutier, S., Deyholos, M.K., et Rowland, G.G. (2016). « Developing EMS flax mutant lines with altered SDG lignan glucosides. », PAGXXIV, San Diego, USA, January 9-13, 2015. (Affiche)
  • Li, P., Cloutier, S., et You, F.M. (2016). « RGAugury: A pipeline for genome-wide prediction of resistance gene analogs (RGAs) in plants. », Great Lakes Bioinformatics and Canadian Computational Biology Conference, Toronto, Canada, May 16-19, 2016. (Affiche)
  • You, F.M., Li, P., Ragupathy, R., Kumar, S., Zhu, T., Luo, M.-C., Duguid, S.D., Rashid, K.Y., Booker, H.M., Deyholos, M.K., Fu, Y.B., Sharpe, A.G., et Cloutier, S. (2016). « The Draft Flax Genome Pseudomolecules. », 66th Flax Institute of the United States, Holiday Inn, Fargo, North Dakota, USA, March 31-April 1, 2016, p. 17-24.

2015

  • Cloutier, S., Mahdi, S.R., Domaratzki, M., Ravichandran, S., et Ragupathy, R. (2015). « Small RNAs underlying genetic and epigenetic mechanisms of adaptation to abiotic stresses in T. aestivum cv Glenlea. », 9th International Wheat Conference 2015, Sydney, Australia, September 20-25, 2015.
  • Fofana, B., Ghose, K., McCallum, J.L., You, F.M., et Cloutier, S. (2015). « UGT74S1 is a single-copy gene and is unique In controlling Secoisolariciresinol Diglucoside (SDG) formation in flax. », Botany 2015 Joint Conference: Science and plants for people, Shaw Convention Center, Edmonton, Alberta, Canada, July 25-30, 2015. (Affiche)
  • Fofana, B., Ghose, K., You, F.M., et Cloutier, S. (2015). « UGT74S1 Is Unique In Controlling Secoisolariciresinol Diglucoside (SDG) Formation In Flax. », XXIII Plant and Animal Genome Conference, San Diego, CA, USA, January 10-14, 2015, p. 160. (Résumé)
  • Shan, Y.F., Li, P., Duguid, S.D., Cloutier, S., Deyholos, M.K., Wang, Y., Gu, Y.Q., Booker, H.M., et You, F.M. (2015). « FlaxDB: A comprehensive and integrated genome and breeding database for flax improvement. », XXIII Plant and Animal Genome Conference, San Diego, CA, USA, January 10-14, 2015. (Affiche)
  • You, F.M., Li, P., Kumar, S., Ragupathy, R., Banik, M., Duguid, S.D., Booker, H.M., Deyholos, M.K., Fu, Y.B., Sharpe, A.G., et Cloutier, S. (2015). « The refined flax genome, its evolution and application. », XXIII Plant and Animal Genome Conference, San Diego, CA, USA, January 10-14, 2015, P1039. (Affiche)
  • You, F.M., Ragupathy, R., Shan, Y.F., et Cloutier, S. (2015). « LTRAnnotator: automated identification and annotation of LTR retrotransposons in plant genomes. », 2015 International Conference on Bioinformatics and Computer Engineering (ICBCE 2015), Chengdu, China, April 18-19, 2015, Oral presentations; won best paper in the bioinformatics section.

2014

  • Cloutier, S. et Robinson, S. (2014). « Epigenetic mechanisms for rapid adaptation to heat stress and elevated CO2 levels. », HeDWIC, Frankfurt, Germany, December 2-4, 2014. (Résumé)
  • Cloutier, S., Rowland, G.G., Booker, H.M., Deyholos, M.K., Datla, R.S.S., Duguid, S.D., Fofana, B., Reaney, M.J.T., Selvaraj, G., Smyth, S., Wang, E., Weselake, R.J., You, F.M., Zou, J.W., et Barker, C. (2014). « The TUFGEN project. », 65th Flax Institute, Fargo, North Dakota, USA, March 27-28, 2014, Oral presentation, p. 39-48.
  • Dakouri, A., McCallum, B.D., Riemer, E., et Cloutier, S. (2014). « Characterization of leaf rust resistance in North American wheat cultivars. », 2014 BGRI Workshop and Borlaug Summit on Wheat for Food Security, Obregon, Sonora, México, March 22-28, 2014. (Résumé)
  • Darbyshire, S.J., Bromfield, E.S.P., Cloutier, S., et Robidas, C. (2014). « Symbiotic association with Neorhizobium galegae limits the dispersal of Galega officinalis (Goat’s Rue) in Canada. », 68th Annual Meeting of the Canadian Weed Science Society - Société canadienne de malherbologie, Montreal, QC, Canada, November 17-20, 2014, p. 31. (Affiche)
  • Fofana, B., Ghose, K., McCallum, J.L., et Cloutier, S. (2014). « Flax SDG lignan glucosylation: from gene discovery to flax lines with altered SDG profiles. », Plant Biology 2014, Portland, Oregon, USA, July 12-16, 2014. (Affiche)
  • Ragupathy, R., Madhi, S.R., Domaratzki, M., et Cloutier, S. (2014). « Micro RNAs and siRNAs underlying genetic and epigenetic mechanisms of adaptation to abiotic stresses in Triticum aestivum cutivar Glenlea. », 2nd Wheat Genetics Symposium, Saskatoon, SK, Canada, June 2014, p. 8. (Affiche)
  • You, F.M., Cloutier, S., Luo, M.-C., et Dvorak, J. (2014). « Genotyping-by-sequencing strategy for genome-wide SNP discovery and genotyping. », 12th Asia Pacific Bioinformatics Conference, Shanghai, China, January 17-19, 2014.

2013

  • Ghose, K., Selvaraj, K., McCallum, J.L., Datla, R.S.S., Cloutier, S., et Fofana, B. (2013). « Key Catalytic Amino Acids for a Flax Secoisolariciresinol Glycosyltransferase as determined by Molecular Modeling and Site-Directed Mutagenesis. », 2013 CSPB/SCBV Annual General Meeting, Laval University, Quebec City, Canada, June 25-28, 2013.
  • Kumar, S. et Cloutier, S. (2013). « Total Utilization Flax GENomics (TUFGEN): Major Thrust-Genomics. », Manitoba Flax Growers Association AGM, Brandon, Manitoba, Canada, January 14, 2013, Oral presentation.
  • Kumar, S., You, F.M., et Cloutier, S. (2013). « The 10K+ SNP maps of flax. », Plant & Animal Genome XXI Conference, Town & Country Convention Center, San Diego, CA, USA, January 12-16, 2013.
  • Ragupathy, R., You, F.M., et Cloutier, S. (2013). « Genome-wide comparative analysis of LTR retrotransposon dynamics In flax (Linum usitatissimum) and Its related genomes, cassava (Manihot esculenta) and poplar (Populus trichocarpa). », Plant & Animal Genome XXI Conference, Town & Country Convention Center, San Diego, CA, USA, January 12-16, 2013.
  • You, F.M., Kumar, S., Banik, M., Ragupathy, R., Deyholos, M.K., Fu, Y.B., Sharpe, A.G., et Cloutier, S. (2013). « Ordering the draft genome sequence of flax (Linum usitatissimum). », Plant & Animal Genome XXI Conference, Town & Country Convention Center, San Diego, CA, USA, January 12-16, 2013.
  • You, F.M., Kumar, S., Ragupathy, R., Deyholos, M.K., Fu, Y.B., Sharpe, A.G., et Cloutier, S. (2013). « Organization and evolution of the flax genome. », 2013 CSPB/SCBV Annual General Meeting, Laval University, Quebec City, Canada, June 25-28, 2013, Poster no. F6, page no. 89 of the abstract book. (Affiche)

2012

  • Cloutier, S., Banik, M., You, F.M., Radovanovic, N., Miranda, D.E., Reimer, E., Ward, K., Walichnowski, A.Z., Rowland, G.G., et Duguid, S.D. (2012). « High Density SSR- and SNP-based Genetic Maps of Flax. », Plant & Animal Genome XX Conference, Town & Country Convention Center, San Diego, CA, USA, January 14-18, 2012. (Affiche)
  • Cloutier, S., Dakouri, A., et McCallum, B.D. (2012). « Haplotype diversity and evolutionary history of the Lr34 locus of a world wheat germplasm collection. », 22nd International Triticeae Mapping Initiative and 4th National wheat genomics Committee joint Workshop, Fargo, ND, USA, June 24-29, 2012, Invited – selected for oral presentation, p. 7.
  • Dakouri, A., McCallum, B.D., Radovanovic, N., et Cloutier, S. (2012). « Molecular and phenotypic characterization of seedling and adult plant resistance in a world wheat collection. », 13th Inter Cereal Rusts and Powdery Mildews Conference, Beijing, China, August 28-September 1, 2012, p. 137.
  • Kumar, S., You, F.M., et Cloutier, S. (2012). « High density genetic maps for flax. », Genomics: The Power and the Promise, the Gairdner Foundation and Genome Canada, Ottawa, ON, Canada, November 27-28, 2012.
  • McCallum, B.D., Hiebert, C.W., Huerta-Espino, J., et Cloutier, S. (2012). « Wheat Leaf Rust. », dans Sharma, I. (dir.) - Disease Resistance in Wheat. CABI Plant Protection Series, CABI Publishing, Wallingford, UK, Chapitre 3, p. 33-63.

2011

  • Dakouri, A., McCallum, B.D., Walichnowski, A.Z., et Cloutier, S. (2011). « Molecular characterization and phenotypic assessment of Lr34 gene in wheat germplasm. », 9th Plant Genomics European Meeting, Istanbul, Turkey, May 4-7, 2011. (Résumé)
  • Selvaraj, K., Ghose, K., Nixon, M., Cloutier, S., et Fofana, B. (2011). « Molecular and functional characterization of flax SDG lignan glycosyltransferases. », Canadian Society of Plant Physiologists Eastern Regional Meeting & Plant Development Workshop / Congrès de la Société Canadienne de Physiologie Végétale & Congrès de Développement Végétale (Congrès Régional de l’Est), Carleton University, Ottawa, ON, Canada, December 2-3, 2011, P22, p. 40.

2010

  • Cloutier, S., Cloutier, S., Rowland, G.G., Datla, R.S.S., Deyholos, M.K., Duguid, S.D., Fofana, B., Reaney, M.J.T., Selvaraj, G., Smyth, S., Wang, E., Weselake, R.J., Zou, J., et Barker, C. (2010). « Total Utilization Flax Genomics (TUFGEN): A Genome Canada Project. », Plant & Animal Genome XVIII Conference, Town & Country Convention Center, San Diego, CA, USA, January 9-13, 2010, P018. (Affiche)
  • Fofana, B., Ragupathy, R., et Cloutier, S. (2010). « Flax Lipids: Classes, biosynthesis, genetics and the promise of applied genomics for understanding and altering of fatty acids. », dans Gilmore, P.L. (dir.) - Lipids: Categories, Biological Functions and Metabolism, Nutrition, and Health, Nova Science Publishers Inc, Chapitre 3, p. 71-98.

2009

  • Bromfield, E.S.P., Tambong, J.T., Cloutier, S., Prévost, D., Laguerre, G., van Berkum, P., Van Tran Thi, T., Assabgui, R., et Barran, L.R. (2009). « Novel bacterial genotypes isolated from nodules of Medicago sativa and Melilotus alba at a Canadian site without a history of legume cultivation. », 3rd Congress of European Microbiologists (FEMS 2009), Gothenburg Convention Centre, Gothenburg, Sweden, June 28-July 2, 2009, p. 451. (Résumé)
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