Genome size variation in the genus Avena.

Yan, H., Martin, S.L., Bekele, W.A., Latta, R.G., Diederichsen, A., Peng, Y.-Y., et Tinker, N.A. (2016). « Genome size variation in the genus Avena. », Genome, 59(3), p. 209-220. doi : 10.1139/gen-2015-0132  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

La taille du génome est indicatrice de la distance évolutive et constitue un élément de caractérisation génomique. Nous présentons ici des estimations précises de la taille du génome de 99 spécimens de 26 espèces d’Avena. Nous montrons que la taille moyenne du génome C d’une espèce diploïde (2C = 10,26 pg) est 15 % supérieure à celle du génome A d’une espèce diploïde (2C = 8,95 pg), et que cette différence explique probablement l’augmentation de la taille chez les espèces tétraploïdes, où AB < AC < CC (moyenne 2C = 16,76, 18,60 et 21,78 pg, respectivement). Tous les spécimens de trois espèces hexaploïdes avec une configuration de génome ACD avaient une taille de génome comparable (moyenne 2C = 25,74 pg). La taille du génome était relativement uniforme chez l’espèce et correspondait généralement aux données actuelles sur la distance évolutive entre des espèces. Les résultats semblent indiquer que, par rapport à leurs géniteurs diploïdes, la taille du génome aurait diminué chez la plupart des espèces polyploïdes d’Avena. La mesure de la taille du génome pourrait servir de contrôle de qualité additionnel pour l’identification des espèces dans les collections de matériel génétique, notamment lorsque les espèces diploïdes et polyploïdes ont une morphologie similaire.

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