Genetic mapping of common bunt resistance and plant height QTL in wheat.

Singh, A., Knox, R.E., DePauw, R.M., Singh, A.K., Cuthbert, R.D., Kumar, S., et Campbell, H.L. (2016). « Genetic mapping of common bunt resistance and plant height QTL in wheat. », Theoretical and Applied Genetics (TAG), 129(2), p. 243-256. doi : 10.1007/s00122-015-2624-8  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

La carie commune est causée par deux champignons transmis par les semences, le Tilletia tritici (Bjerk.) Wint. [syn. Tilletia caries (DC.) Tul.] et le Tilletia laevis Kühn [syn. Tilletia foetida (Wallr.) Liro.]. Cette maladie entraîne une diminution du rendement grainier et de la qualité des cultures de blé, à cause de la formation de balles sporifères et de l’infestation des grains. Notre étude visait à identifier et à cartographier des locus de caractères quantitatifs (QTL) pour la résistance à la carie commune, à étudier les interactions épistatiques entre les QTL identifiés et à analyser la colocalisation des locus associés à la résistance à la carie commune et à la hauteur de la plante. Nous avons génotypé une population de 261 lignées dihaploïdes issues du croisement Carberry/AC Cadillac ainsi que des lignées témoins au moyen de marqueurs microsatellites et de marqueurs DArT® polymorphes couvrant l’ensemble du génome. Les lignées ont été cultivées en 2011, 2012 et 2013 dans des pépinières différentes aux fins de la détermination de la fréquence de la carie commune et de la hauteur des plantes. AC Cadillac a fourni un QTL (QCbt.spa-6D) pour la résistance à la carie commune sur le chromosome 6D aux marqueurs XwPt-1695, XwPt-672044 et XwPt-5114. Carberry a fourni un QTL pour la résistance à la carie commune sur les chromosomes 1B (QCbt.spa-1B à XwPt743523) 4B (QCbt.spa-4B à XwPt-744434-Xwmc617), 4D (QCbt.spa-4D à XwPt-9747), 5B (QCbt.spa-5B à XtPt-3719) et 7D (QCbt.spa-7D à Xwmc273). Des interactions épistatiques importantes ont été identifiées pour la fréquence en pourcentage de la carie commune, entre QCbt.spa-1B × QCbt.spa-4B et QCbt.spa-1B × QCbt.spa-6D, et pour l’interaction QTL-environnement, entre QCbt.spa-1B × QCbt.spa-6D. Des QTL associés à la hauteur de la plante ont été trouvés sur les chromosomes 4B (QPh.spa-4B) et 6D (QPh.spa-6D) et étaient colocalisés avec des QTL de résistance à la carie commune. L’identification de QTL de résistance à la carie commune qui n’avaient jamais été signalés (sur les chromosomes 4B, 4D et 7D) et de nouvelles connaissances sur les interactions QTL × QTL faciliteront la sélection assistée par marqueurs visant la résistance à la carie commune. Message clé : Les travaux d’amélioration de la résistance à la carie commune dans les cultures de blé devront tenir compte de multiples gènes et de multiples interactions épistatiques et interactions QTL-environnement. Les locus associés à la résistance quantitative à la carie commune sont colocalisés avec des locus liés à d’autres caractères bénéfiques, comme la hauteur de la plante et la résistance à la rouille.

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