The complete nucleotide sequence and genome organization of pea streak virus (genus Carlavirus).

Su, L., Li, Z.N., Bernard, M., Bernardy, M.G., Wiersma, P.A., Cheng, Z.H., et Xiang, Y. (2015). « The complete nucleotide sequence and genome organization of pea streak virus (genus Carlavirus). », Archives of Virology, 160(7). doi : 10.1007/s00705-015-2467-2  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

Le virus de la striure du pois (PeSV, pour pea streak virus) appartient au genre Carlavirus de la famille des Betaflexiviridae. Nous présentons ici la séquence du premier génome complet du PeSV, déterminé par séquençage profond d’une banque d’ADNc construite avec un échantillon infecté au PeSV et l’amplification rapide des extrémités d’ADNc. Sans la queue de poly(A), le génome du PeSV compte 8041 nucléotides et six cadres de lecture ouverts (ORF). Le peptide vraisemblablement codé par l’ORF6 a une masse moléculaire estimée de 6,6 kDa et ne présente aucune similarité aux protéines connues. Cette donnée ne cadre pas avec ce que l’on voit chez les carlavirus typiques, où l’ORF6 code une protéine de liaison aux acides nucléiques, de 12 à 18 kDa, riche en cystéine.

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