Genome Assemblies of Three Soil-Associated Devosia species: D. insulae, D. limi, and D. soli.

Hassan, Y.I., Lepp, D., et Zhou, T. (2015). « Genome Assemblies of Three Soil-Associated Devosia species: D. insulae, D. limi, and D. soli. », Genome Announcements, 3(3: Article e00514-15).

Résumé

Les sols agricoles forment des écosystèmes hautement diversifiés avec de riches populations bactériennes. Dans les études récentes faites avec des techniques de séquençage de prochaine génération, les chercheurs ont commencé à explorer la dynamique des espèces bactériennes dans de tels sols et à utiliser des approches de métagénomique pour comprendre comment la diversité des microorganismes du sol change selon les pratiques agricoles. Dans cette ère de génomique, pour comprendre l’adaptabilité des microorganismes à leur environnement, il faut comprendre leur génome codant. Nous présentons ici l’ébauche de la séquence du génome de trois espèces de Devosia fondée sur trois souches types provenant d’échantillons de sol : souche DS-56 de D. insulae, souche DSM17137 de D. limi et souche GH2-10 de D. soli.

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