QTL for fatty acid composition and yield in linseed (Linum usitatissimum L.).

Kumar, S., You, F.M., Duguid, S.D., Booker, H.M., Rowland, G.G., et Cloutier, S. (2015). « QTL for fatty acid composition and yield in linseed (Linum usitatissimum L.). », Theoretical and Applied Genetics (TAG). doi : 10.1007/s00122-015-2483-3  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

Key message: La combinaison de la carte des séquences microsatellites et marqueurs de polymorphisme mononucléotidique et de vingt locus à caractère quantitatif liés à des traits agronomiques et qualitatifs contribuera à la sélection à l’aide de marqueurs moléculaires et au clonage positionnel de gènes clés du lin. Le lin est une culture nutraceutique importante, surtout parce qu’il est une source abondante d’acides gras oméga 3 et de composés antioxydants. Le Canada est le plus grand producteur et exportateur de lin oléagineux (graines de lin), il existe donc une nécessité croissante d’améliorer le rendement et la qualité des récoltes. Dans le cadre de cette étude, nous avons construit une carte génétique fondée sur 329 polymorphismes mononucléotidiques sélectionnés et 362 répétitions de séquences simples microsatellites d’une population de lignées recombinées autofécondées d’un hybride des variétés canadiennes CDC Bethune et Macbeth. La carte génétique consiste en 15 groupes de liaisons formés de 691 marqueurs avec une densité moyenne d’un marqueur pour chaque 1,9 cM. Un total de 20 locus à caractère quantitatif (QTL) correspondant à 14 traits ont été découverts. Nous avons trouvé 3 QTL chacun pour les acides oléique et stéarique, 2 QTL chacun pour l’acide linoléique et l’indice d’iode et 1 QTL chacun pour l’acide palmitique, l’acide linolénique, la teneur en huile, la protéine des graines, la paroi cellulaire, la masse de la paille, la masse de mille graines, le nombre de graines par capsule, le rendement et la précocité de maturation. Les QTL pour la paroi cellulaire, la masse de la paille, le nombre de graines par capsule, la productivité et la précocité de maturation sont tous situés sur le groupe de liaison 4. L’analyse des régions des gènes candidats sous-tendant le QTL a recensé les protéines participant à la synthèse des parois cellulaires et des fibres, à la biosynthèse des acides gras ainsi qu’aux traits participant au métabolisme et au rendement. Cette étude fournit les bases pour aider au clonage positionnel des QTL et la sélection à l’aide de marqueurs moléculaires d’un vaste éventail de traits qualitatifs et agronomiques de la graine de lin et potentiellement de la fibre de lin.

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