Accuracy of predicting genomic breeding values for carcass merit traits in Angus and Charolais beef cattle.

Chen, L., Vinsky, M.D., et Li, C. (2015). « Accuracy of predicting genomic breeding values for carcass merit traits in Angus and Charolais beef cattle. », Animal Genetics, 46(1), p. 55-59. doi : 10.1111/age.12238  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

Nous avons examiné l’exactitude de la valeur d’élevage génomique prévue en ce qui a trait aux caractéristiques liées à la valeur de la carcasse, comme son poids chaud, la surface du Longissimus (SL), l’épaisseur moyenne du gras dorsal (EMGD), le rendement en viande maigre (RVM) et le persillage en fonction du génotype de 543 bouvillons Angus et 400 bouvillons Charolais séquencé avec la puce à billes BovineSNP50 d’Illumina. Pour la prédiction de la valeur génomique chez les bovins Angus, l’exactitude moyenne était de 0,35, (de 0,32 [RVM] à 0,37 [persillage]) pour différentes stratégies de fractionnement de données d’ensembles d’apprentissage et de validation ainsi que diverses méthodes statistiques. Pour la prédiction génomique intra-race chez les bouvillons Charolais, l’exactitude moyenne était de 0,36 (de 0,24 [SL] à 0,46 [EMGD]). La prédiction inter-race était très faible, en moyenne près de zéro. Lorsque les données des deux races ont été combinées pour prédire les valeurs d’élevage d’une ou l’autre race, l’exactitude de la prédiction a été de 0,35 en moyenne pour les bouvillons Angus (de 0,33 [SL] à 0,39 ([persillage]) et de 0,33 en moyenne pour les Charolais (de 0,18 [SL] à 0,46 (EMGD]). L’exactitude de prédiction était légèrement plus élevée en moyenne lorsque les données ont été fractionnées en fonction de l’année de naissance de l’animal que lorsqu’elles ont été fractionnées en fonction de la famille paternelle. Ces résultats montrent l’importance du lien génétique ou de la parenté des candidats de reproduction avec la population d’apprentissage pour l’exactitude des valeurs d’élevage génomiques prévues avec la densité des ensembles de marqueurs utilisés dans cette étude.

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