Centromeric position and genomic allocation of a repetitive sequence isolated from chromosome 18D of hexaploid oat, Avena sativa L.

Luo, X., Tinker, N.A., Zhang, H., Wight, C.P., Kang, H., Fan, X., Wang, Y., Sha, L., et Zhou, Y.-H. (2015). « Centromeric position and genomic allocation of a repetitive sequence isolated from chromosome 18D of hexaploid oat, Avena sativa L. », Genetic Resources and Crop Evolution, 62(1), p. 1-4. doi : 10.1007/s10722-014-0170-x  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

L’avoine cultivée (Avena sativa L.) est allohexaploïde et possède trois génomes (A, C et D). Par hybridation in situ en fluorescence, nous avons pu établir qu’un fragment d’ADN répétitif de 391 pb (‘A336’) extrait du chromosome 18D de l’avoine se retrouve principalement dans les régions centromériques chez les chromosomes en métaphase mitotique de l’avoine ‘CN64226’. En effectuant des cohybridations simultanées et séquentielles avec la sonde d’ADN répétitif ‘pAm1’ spécifique au génome C, extraite de l’espèce tétraploïde A. murphyi Ladiz. (AACC), et en appliquant diverses concentrations de la sonde A336, nous avons pu constater que le segment d’ADN A336 est plus abondant dans les chromosomes des génomes A et D que dans ceux du génome C. Nos résultats pourraient se révéler utiles dans le cadre d’études cytogénétiques et faciliter l’assemblage physique de génomes.

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