Advancing knowledge on biology of rust fungi through genomics.

Duplessis, S., Bakkeren, G., et Hamelin, R.C. (2014). « Advancing knowledge on biology of rust fungi through genomics. », dans Martin, F.M. (dir.) - Advances in Botanical Research Vol. 70, Academic Press, Chapitre 6, p. 173-209.

Résumé

Les Pucciniales forment un groupe important de pathogènes fongiques des végétaux qui causent la rouille chez divers hôtes, notamment des cultures et des arbres d’importance écologique et économique. Les champignons responsables de la rouille présentent des cycles vitaux intrigants et complexes, et sont des biotrophes obligatoires. En raison de leurs caractéristiques biologiques, ils sont très difficiles à étudier en laboratoire. Les avancées dans les domaines de la génomique et de la transcriptomique offrent de bonnes perspectives en ce qui concerne l’étude de ce groupe de champignons, particulièrement la dissection des déterminants génétiques qui sous tendent le processus d’infection des hôtes. Dans le présent chapitre, les auteurs fournissent un aperçu des connaissances actuelles sur la génomique de la rouille, et s’attardent particulièrement sur les progrès engendrés par les technologies de séquençage haut débit (NGS), qui offrent de nouvelles pistes quant à la compréhension de la biotrophie fongique.

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