Aspergillus, Penicillium and Talaromyces isolated from house dust samples collected around the world.

Visagie, C.M., Hirooka, Y., Tanney, J.B., Whitfield, E., Mwange, K.N., Meijer, M., Amend, A.S., Seifert, K.A., et Samson, R.A. (2014). « Aspergillus, Penicillium and Talaromyces isolated from house dust samples collected around the world. », Studies in Mycology, 78(1), p. 63-139. doi : 10.1016/j.simyco.2014.07.002  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

Dans le cadre d’une enquête mondiale portant sur la mycoflore intérieure, des échantillons de poussière ont été recueillis en provenance de neuf pays. Les analyses des échantillons de poussière ont été réalisées au moyen de la méthode reposant sur le principe de dilution jusqu’à extinction spécifique à une culture et du séquençage selon la technique 454 (pyroséquençage) indépendante de la culture. Des 7 904 isolats, 2 717 ont été identifiés comme appartenant à Aspergillus, Penicillium et Talaromyces. Le but de la présente étude était d’identifier les isolats à l’échelon de l’espèce et de décrire les espèces récemment identifiées. Deuxièmement, nous voulions créer une base de données de référence fiable sur les séquences à utiliser pour les projets de séquençage de prochaine génération. Les isolats représentaient 59 espèces du genre Aspergillus, y compris huit espèces non décrites, 49 espèces du genre Penicillium, dont sept étaient non décrites, et 18 espèces du genre Talaromyces, dont trois sont décrites dans la présente comme de nouvelles espèces. Au total, on a obtenu 568 codes-barres d’espaceurs internes transcrits (ITS) ainsi que 391 séquences de β-tubuline et 507 séquences de calmoduline, qui servent de marqueurs d’identification de rechange.

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