A chromosome-based draft sequence of the hexaploid bread wheat (Triticum aestivum) genome.

Lukaszewski, A.J., Alberti, A., Sharpe, A.G., Kilian, A., Stanca, A.M., Keller, B., Knox, R.E., et les autres (2014). « A chromosome-based draft sequence of the hexaploid bread wheat (Triticum aestivum) genome. », Science, 345(6194: Article 1251788). doi : 10.1126/science.1251788  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

Nous avons obtenu une séquence préliminaire ordonnée du génome de 17 gigabases du blé commun hexaploïde (Triticum aestivum) en séquençant isolément les bras des divers chromosomes. Nous avons annoté 124 201 locus distribués presque uniformément dans l’ensemble des chromosomes homéologues et des sous-génomes. Une analyse comparative des sous-génomes du blé par rapport aux espèces apparentées diploïdes et tétraploïdes existantes a révélé que le blé avait conservé une forte similitude de séquence et de structure et avait peu perdu de gènes à la suite de sa polyploïdisation. Cependant, dans l’ensemble des génomes, on observe des signes de gains, de pertes et de duplications de gènes qui seraient survenus de manière dynamique depuis la divergence des diverses lignées de blé. Nous avons observé dans les sous-génomes un degré élevé d’autonomie transcriptionnelle et une absence de dominance globale. Ces nouvelles perspectives sur la biologie génomique d’une plante cultivée polyploïde devraient accélérer le repérage des gènes et la mise au point de marqueurs génétiques, ce qui devrait permettre des travaux d’amélioration plus précis répondant aux besoins alimentaires croissants de la planète.

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