Using structure to inform carbohydrate binding module function.

Abbott, D.W. et Lammerts van Bueren, A. (2014). « Using structure to inform carbohydrate binding module function. », Current Opinion in Structural Biology, 28, p. 32-40. doi : 10.1016/j.sbi.2014.07.004  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

De manière générale, il a été démontré que la spécificité non catalytique d’un module de liaison aux glucides (CBM) existe en parallèle avec l’activité catalytique du module d’enzymes actives sur les glucides (CAZyme) auquel il est associé. Avec l’expansion rapide de l’espace des séquences métagénomiques pour la découverte potentielle de nouveaux CBM, en plus de l’émergence récente de plusieurs nouvelles familles de CBM présentant divers profils de liaison ainsi que de nouvelles fonctions, la compréhension des fonctions de ces modules de protéines est devenue une tâche beaucoup plus ardue. La présente étude résume plusieurs approches fondées sur l’utilisation de la structure primaire dans le but d’étayer la spécificité des CBM et de faciliter la caractérisation biophysique de ces derniers. Nous abordons également les tendances générales de l’architecture des sites de liaison et de plusieurs fonctions des CBM nouvellement découvertes. Des pistes de recherche qui faciliteront l’élaboration et l’amélioration des outils de prédiction fondés sur les séquences sont suggérées.

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