Assembling a core collection from the flax world collection maintained by Plant Gene Resources of Canada.

Diederichsen, A., Kusters, P.M., Kessler, D., Bainas, Z., et Gugel, R.K. (2013). « Assembling a core collection from the flax world collection maintained by Plant Gene Resources of Canada. », Genetic Resources and Crop Evolution, 60(4), p. 1479-1485. doi : 10.1007/s10722-012-9936-1  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

De 1998 à 2008, de nombreux projets de la banque nationale de gènes du Canada, Ressources phytogénétiques du Canada, ont visé à régénérer, caractériser et évaluer l’ensemble de la collection de matériel génétique de lin (Linum usitatissimum L.). Cette collection comprenait 3378 obtentions, dont plusieurs, selon les données passeport, étaient probablement très semblables ou même identiques sur le plan génétique. Nous avons donc voulu sélectionner un sous-ensemble de 381 obtentions qui soit représentatif de toute la diversité de la collection. Pour réaliser l’échantillonnage, nous avons utilisé les données de caractérisation et d’évaluation et avons suivi six méthodes distinctes : (1) dans le cas de sept caractères qualitatifs, nous avons retenu trois obtentions pour chaque combinaison particulière de l’expression des caractères; (2) dans le cas des caractères quantitatifs, nous avons retenu un nombre fixe d’obtentions où étaient représentées les valeurs minimale et maximale observées; (3) dans le cas des cotes de maladie, de la teneur en fibre des tiges, de la vigueur des semences et de la tolérance à la sécheresse, nous avons retenu un nombre fixe d’obtentions ayant une performance souhaitable; (4) nous avons retenu un sous-ensemble des 57 obtentions qui s’étaient révélées les plus distinctes selon les marqueurs RAPD; (5) nous avons retenu un sous-ensemble de 40 lignées pures créées en fonction des valeurs minimale et maximale extrêmes du poids de mille graines, de la teneur en huile des graines et de leur profil d’acides gras; (6) nous avons enfin retenu un sous-ensemble de cultivars de lin à fibre dont nous connaissions l’importance pour les programmes de sélection européens et un sous-ensemble de cultivars de lin oléagineux dont nous connaissions l’importance pour les programmes de sélection nord-américains. L’objectif était de maximiser la diversité offerte par un nombre limité d’obtentions tout en préservant la gamme de variation de l’ensemble de la collection et en améliorant son homogénéité. Nous avons établi cette collection de base à la suite de demandes des sélectionneurs de lin. Dans le présent article, nous comparons les paramètres de distribution de la collection de base à ceux de la collection complète.

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