Crowdsourcing genomic analyses of ash and ash dieback–power to the people.

MacLean, D., Yoshida, K., Edwards, A., Crossman, L., Clavijo, A., Clark, M., Swarbreck, D., Bashton, M., Chapman, B. P., Gijzen, M., Caccamo, M., Downie, J.A., Kamoun, S., et Saunders, D.G.O. (2013). « Crowdsourcing genomic analyses of ash and ash dieback–power to the people. », GigaScience, 2(2), p. 1-3. doi : 10.1186/2047-217x-2-2  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

Le flétrissement du frêne est une maladie dévastatrice touchant le frêne. Le champignon responsable de la maladie s’est propagé en Europe et a récemment atteint le Royaume-Uni. Cet agent pathogène émergent, qui compromet la pérennité des populations de frêne, a fait l’objet de peu d’études dans le passé. Nous avons donc produit des ensembles de données de génomique et avons pris l’inhabituelle initiative de les soumettre à la communauté scientifique aux fins d’analyse, avant même que nous ayons réalisé nos propres analyses. De cette façon, nous voulions « externaliser à grande échelle » les analyses et amener la communauté scientifique à se pencher sur ce problème aussi rapidement que possible. Nous avons affiché nos données sur notre site Web (oadb.tsl.ac.uk) et les avons versées dans un dépôt public GitHub.

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