High-throughput species identification of enterococci using pyrosequencing.

Zaheer, R., Yanke, L.J., Church, D., Topp, E., Read, R.R., et McAllister, T.A. (2012). « High-throughput species identification of enterococci using pyrosequencing. », Journal of Microbiological Methods, 89(3), p. 174-178. doi : 10.1016/j.mimet.2012.03.012  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

Nous présentons ici la mise au point et la validation d’une méthode automatisée de pyroséquençage à haut débit pour l’identification fiable, jusqu’à l’espèce, des isolats d’Enterococcus. La méthode exploite la spécificité discrète de la région hypervariable de l’espaceur groES-EL et fait appel à un ordre de distribution universel optimisé pour un vaste éventail d’espèces du genre Enterococcus.

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