Arbuscular mycorrhizal fungi assemblages in Chernozem great groups revealed by massively parallel pyrosequencing.

Dai, M., Hamel, C., St. Arnaud, M., He, Y., Grant, C.A., Lupwayi, N.Z., Janzen, H.H., Malhi, S.S., Yang, X., et Zhou, Z. (2012). « Arbuscular mycorrhizal fungi assemblages in Chernozem great groups revealed by massively parallel pyrosequencing. », Canadian Journal of Microbiology, 58(1), p. 81-92. doi : 10.1139/W11-111  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

Les ressources en champignons mycorhizes arbusculaires (MA) de champs de blé des Prairies canadiennes ont été explorées par pyroséquençage 454. Parmi les 33 unités taxonomiques opérationnelles (UTO) dominantes de champignons MA trouvées dans 76 champs de blé examinés à l’anthèse, en 2009, 14 s’agrégeaient à Funneliformis-Rhizofagus, 16 à Claroideoglomus et 3 aux Diversisporales. Les UTO de deux MA, un Funneliformis mosseae et un Diversisporales, constituaient chacune approximativement 16 % de toutes les UTO de champignons MA. Le premier était ubiquiste alors que le deuxième était principalement limité aux chernozems noirs et brun foncé. La composition des UTO de la communauté de champignons MA s’expliquait davantage par les grands groupes de chernozems (P = 0,044) que par les propriétés mesurées du sol. Cinquante-deux pourcent desUTO de champignons MA n’étaient non reliées aux propriétés mesurées du sol. Les chernozems noirs abritaient la diversité la plus élevée d’UTO de champignons MA et presque deux fois le nombre de séquences de champignons MA observées dans les chernozems brun foncé, le grand groupe se classant deuxième quant à l’abondance de séquences de champignons MA. Les chernozems bruns abritaient l’abondance la plus faible de champignons MA et leur diversité était aussi faible que celle des sols gris.Nous avons conclu que les chernozems noirs sont les plus propices à la prolifération des champignons MA. Les champignons MA sont généralement distribués selon les grands groupes de chernozems dans les Prairies canadiennes, quoique certains taxons soient distribués aléatoirement dans tous les groupes de sols.