Molecular characterization of two prunus necrotic ringspot virus isolates from Canada.

Cui, H., Hong, N., Wang, G.P., et Wang, A.M. (2012). « Molecular characterization of two prunus necrotic ringspot virus isolates from Canada. », Archives of Virology, 157(5), p. 999-1001. doi : 10.1007/s00705-1247-5  Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Résumé

Nous avons déterminé la séquence entière des ARN1, 2 et 3 de deux isolats du virus des taches annulaires nécrotiques du prunier (PNRSV) : Chr3 provenant de la cerise et Pch12, de la pêche, deux fruits d’un verger de la zone de production fruitière du Niagara, au Canada. Les séquences de nucléotides des ARN1, 2 et 3 des deux isolats sont identiques à 98,6 %, 98,4 % et 94,5 %, respectivement. La séquence des acides aminés codée par l’ARN1 et l’ARN2 présente une homologie d’environ 98 % avec la séquence correspondante d’un isolat de cerise : le CH57, le seul autre isolat du PNRSV pour lequel on connaît la séquence entière des ARN1 et ARN2. L’analyse phylogénétique de la protéine de l’enveloppe et de la protéine de transport codées par l’ARN3 de Pch12 et de Chr3, par rapport aux séquences protéiniques du PNRSV, indique que l’isolat Chr3 appartient au groupe PV96, et le Pch12, au groupe PV32

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